Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup188Q6ZQH8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup188Q6ZQH8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup188Q6ZQH8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms