Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Efr3bQ6ZQ18 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efr3bQ6ZQ18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Efr3bQ6ZQ18 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Efr3bQ6ZQ18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Efr3bQ6ZQ18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Efr3bQ6ZQ18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Efr3bQ6ZQ18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Efr3bQ6ZQ18 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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