Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ino80Q6ZPV2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ino80Q6ZPV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ino80Q6ZPV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms