Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbf1Q6ZPE2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sbf1Q6ZPE2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sbf1Q6ZPE2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms