Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift172Q6VH22 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ift172Q6VH22 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ift172Q6VH22 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift172Q6VH22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms