Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Timd4Q6U7R4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Timd4Q6U7R4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 674.8 ms