Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt9Q6RHW0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt9Q6RHW0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt9Q6RHW0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms