Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tcaf3Q6QR59 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcaf3Q6QR59 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tcaf3Q6QR59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms