Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tlr12Q6QNU9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlr12Q6QNU9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlr12Q6QNU9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms