Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bnip1Q6QD59 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.4 ms