Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clca4aQ6Q473 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clca4aQ6Q473 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clca4aQ6Q473 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms