Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1a3Q6PIC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp1a3Q6PIC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp1a3Q6PIC6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms