Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup98Q6PFD9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nup98Q6PFD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup98Q6PFD9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms