Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pik3c3Q6PF93 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pik3c3Q6PF93 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms