Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dhx40Q6PE54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Dhx40Q6PE54 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dhx40Q6PE54 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms