Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zbtb39Q6PDK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zbtb39Q6PDK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms