Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bhlhb9Q6PB60 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bhlhb9Q6PB60 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhb9Q6PB60 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms