Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Lce3fQ6PAI4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Lce3fQ6PAI4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms