Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slf2Q6P9P0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Slf2Q6P9P0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slf2Q6P9P0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slf2Q6P9P0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms