Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Podnl1Q6P3Y9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Podnl1Q6P3Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Podnl1Q6P3Y9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms