Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig8Q6P3A4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vsig8Q6P3A4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsig8Q6P3A4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig8Q6P3A4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms