Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Frg2f1Q6P3A2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Frg2f1Q6P3A2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Frg2f1Q6P3A2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms