Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrig3Q6P1C6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrig3Q6P1C6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrig3Q6P1C6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms