Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc189Q6NZQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc189Q6NZQ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc189Q6NZQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms