Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SphkapQ6NSW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SphkapQ6NSW3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SphkapQ6NSW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms