Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
2810408A11RikQ6NSU2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2810408A11RikQ6NSU2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms