Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amer3Q6NS69 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amer3Q6NS69 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms