Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg16l2Q6KAU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg16l2Q6KAU8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms