Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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Krt77Q6IFZ6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt77Q6IFZ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Krt77Q6IFZ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Krt77Q6IFZ6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt77Q6IFZ6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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