Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt40Q6IFX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt40Q6IFX3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt40Q6IFX3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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