Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Best3Q6H1V1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Best3Q6H1V1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Best3Q6H1V1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Best3Q6H1V1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms