Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q6GQU0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q6GQU0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6GQU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q6GQU0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q6GQU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms