Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Carmil1Q6EDY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Carmil1Q6EDY6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Carmil1Q6EDY6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Carmil1Q6EDY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Carmil1Q6EDY6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Carmil1Q6EDY6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms