Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nop58Q6DFW4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nop58Q6DFW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nop58Q6DFW4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms