Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ltn1Q6A009 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ltn1Q6A009 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ltn1Q6A009 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms