Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q66JV7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q66JV7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q66JV7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q66JV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q66JV7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q66JV7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q66JV7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q66JV7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q66JV7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q66JV7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q66JV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q66JV7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q66JV7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms