Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lrrc8eQ66JT1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lrrc8eQ66JT1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms