Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnna3Q65CL1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna3Q65CL1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms