Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja3Q64448 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gja3Q64448 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja3Q64448 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms