Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf4Q64310 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Surf4Q64310 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms