Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nhlh2Q64221 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh2Q64221 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms