Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScxQ64124 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScxQ64124 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ScxQ64124 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms