Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CochQ62507 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CochQ62507 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CochQ62507 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CochQ62507 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CochQ62507 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CochQ62507 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CochQ62507 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CochQ62507 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CochQ62507 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CochQ62507 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CochQ62507 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CochQ62507 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CochQ62507 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CochQ62507 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms