Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vat1Q62465 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vat1Q62465 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vat1Q62465 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms