Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20865Q62460 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20865Q62460 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20865Q62460 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20865Q62460 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms