Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nptx1Q62443 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nptx1Q62443 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms