Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tff3Q62395 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tff3Q62395 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms