Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SypQ62277 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SypQ62277 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SypQ62277 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SypQ62277 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SypQ62277 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SypQ62277 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SypQ62277 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SypQ62277 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SypQ62277 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SypQ62277 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SypQ62277 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SypQ62277 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SypQ62277 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SypQ62277 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SypQ62277 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SypQ62277 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SypQ62277 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SypQ62277 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SypQ62277 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms