Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scn9aQ62205 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scn9aQ62205 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms