Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssr4Q62186 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ssr4Q62186 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ssr4Q62186 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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